El sistema de puntuación de la Euskal Herriko Kopa y sus categorías ha variado con respecto a ediciones anteriores. Este año, el campeón o la campeona de cada prueba obtendrá 100 puntos para la clasificación general, restando de 5 puntos en 5 puntos para cada persona que se clasifique por detrás, hasta la posición 20, que obtendrá 5 puntos. Las personas que lleguen entre las posiciones 21 y 30 obtendrán 2 puntos y las personas que terminen la carrera a partir de la posición 31 obtendrán 1 punto, siempre y cuando terminen dentro del control.

En el caso de las subcategorías cadete, juvenil y junior, las personas participantes deberán completar un total de 4 pruebas con el mismo valor de puntuación, teniéndose en cuenta los 3 mejores resultados.

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