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2021 a 2024 Zigor Eguia Suances Presidente desde marzo de 2021 como única candidatura respaldada por las 3 federaciones territoriales.

2017 a 2020 José Ramón Alonso Elegido Presidente, tras elecciones, en Asamblea celebrada en febrero de 2017.

2013 a 2016 Joseba Ugalde Presidente desde enero de 2013 como única candidatura.

2012 a 2013 Álvaro Arregi Otadui

2009 a 2011 Luis Ignacio Domingo Uriarte Elegido Presidente en Asamblea celebrada en enero de 2009 y en el cargo hasta octubre de 2011.

2005 a 2008 Arantza Jausoro Marugán En febrero de 2005, la Asamblea de clubs reunida en Elgeta, elegía a Arantza Jausoro para presidir la EMF, la primera y única mujer presidenta de la EMF hasta hoy en día.

2000 a 2004 Antxon Bandrés Zaragüeta Fue presidente de la Federación Vasca durante dos legislaturas (1975-1979 y 2000-2004).

1986 a 2000 Francisco Iriondo Lizarralde Ocupó la presidencia desde julio de 1986 hasta noviembre del 2000.

1984 a 1986 José María Leturia

1981 a 1984 Juan Bautista Maiz Agirre En diciembre de 1981 es nombrado nuevo presidente Juan Bautista Maíz.